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Hay más microbios en un puñado de tierra que estrellas en la galaxia

Los investigadores han descubierto 1.000 nuevos genomas microbianos

Martes, 13 de Junio de 2017 - Actualizado a las 10:18h

Un agricultor muestra un puñado de tierra.

Un agricultor muestra un puñado de tierra. (n.g.)

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Un agricultor muestra un puñado de tierra.

Nueva York. El número de microbios en un puñado de tierra supera el número de estrellas en la galaxia de la Vía Láctea, pero los investigadores saben menos de lo que hay en la Tierra porque solo recientemente han tenido las herramientas para explorar lo que está justo debajo. Ahora, científicos del Instituto de Genoma Conjunto del Departamento de Energía de EEUU han dado un paso decisivo en el estudio de la diversidad microbiana del planeta.

En un artículo que se publicó ayer en Nature Biotechnology, el doctor Nikos Kyrpides y su equipo de investigadores detallan 1.003 genomas filogenéticamente diversos de referencia bacteriana y de arqueas. "Las bacterias y las arqueas constituyen la mayor cantidad de biodiversidad de organismos libres en la Tierra", afirma Kyrpides, autor principal del documento. "Ya han conquistado todos los ambientes del planeta, por lo que han encontrado formas de sobrevivir bajo las más duras condiciones con diferentes enzimas y diferentes bioquímicos", añade.

El Departamento de Energía de los Estados Unidos está interesado en aprender más sobre esta biodiversidad porque los microbios juegan un papel importante en la regulación de los ciclos biogeoquímicos de la Tierra, procesos que gobiernan la circulación de nutrientes en ambientes terrestres y marinos, por ejemplo. Descubrir las funciones de genes, enzimas y vías metabólicas a través de la secuenciación y el análisis del genoma tiene amplias aplicaciones en los campos de la bioenergía, la biomedicina, la agricultura y las ciencias ambientales.

El esfuerzo es parte de la iniciativa genética del genoma de las bacterias y arqueas (GEBA, por sus siglas en inglés) del DOE JGI que trabaja para secuenciar millares de genomas bacterianos y de arqueas para llenar las ramas inexploradas del árbol de la vida. "Además de identificar más de medio millón de nuevas familias de proteínas, este esfuerzo ha más que duplicado la cobertura de la diversidad filogenética de todos los tipos de cepas con secuencias del genoma", señala el primer coautor del artículo, Supratim Mukherje.

La publicación de estos genomas es la culminación de casi una década de trabajo, con los primeros 56 genomas de GEBA publicados en 2009. Los microorganismos fueron aislados de ambientes que van desde el agua de mar y el suelo, a las plantas, y el rumen de la vaca y las tripas de las termitas. La secuenciación y el análisis del genoma se realizaron a través del Community Science Program y los 1.003 genomas están disponibles a través del Sistema de Microorganismos Microbianos Integrados (IMG/M), con todos los metadatos asociados.

Todos estos genomas fueron publicados inmediatamente después de la secuenciación para maximizar su uso por la comunidad científica más grande, de acuerdo con la práctica del DOE JGI de liberación inmediata de datos, subraya la coautora Tanja Woyke, jefa del Microbial Genomics Program. E. Press


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